本发明公开了一种复杂压缩机轴系的分步骤动平衡方法，其包括以下步骤：S1：第一次动平衡，将压缩机转子的轮毂分别单独进行动平衡；S2：第二次动平衡，将压缩机转子的轮毂与主轴等装配后进行动平衡；S3：第三次动平衡，在第二次动平衡的基础上，将压缩机转子装配已称重和排序过的叶片后进行动平衡；S4：第四次动平衡，将压缩机中间轴部件进行动平衡本发明对压缩机轴系中的转子和中间轴采用分步骤的动平衡方法，可以极大提高平衡精度，降低振动风险；本发明由于产品结构和动平衡安全等原因，没法直接使用动平衡块进行配重，在动平衡过程需采用工艺件进行临时配重，待转动部件动平衡完成后，再照配动平衡配。