本发明公开了一种能够中和马流感病毒的全马源单克隆抗体及其应用。所述的全马源单克隆抗体由轻链和重链组成，其中轻链的氨基酸序列如SEQ ID NO.1所示，重链的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。细胞实验以及动物实验均证明该全马源单克隆抗体具有很好的中和马流感流行毒株JL89的能力。因此，该全马源单克隆抗体具有极高的研究价值，可以在大流行早期进行被动免疫保护，以减轻病毒在疫苗生产期间的危害。同时，本发明重点分析了该全马源单克隆抗体与HA蛋白的结合表位，为保护性流感疫苗的开发提供了基础。