本发明所提供的航空发动机高频振动处理诊断方法及系统，方法是通过根据航空发动机监控对象的关键设计参数，获取关键特征频率；采集监控对象的振动冲击信号，结合关键特征频率，计算获取谐振参数；通过该谐振参数对振动冲击信号进行谐振处理，得到增强后的振动冲击信号；结合关键特征频率提取增强后的振动冲击信号中的故障特征值；通过故障特征值计算故障程度值，预设预警阈值并与故障程度值进行比较，输出故障诊断结果。相比于现有技术，本方法通过已获取的谐振参数对振动冲击信号进行多次谐振处理，实现了对早期微弱的故障信号进行增强，在信号增强过程中去除了其中的噪声干扰，进而提高了故障诊断结果的准确性。该系统具有相同的有益效果。