本发明公开一种考虑滞箱时间的集装箱空箱多式联运路径优化方法。该方法包括：针对集装箱的多式联合调运问题，建立空箱调运路径选择模型，其中所述空箱调运路径选择模型以多种运输方式的运输量和路径作为决策变量，并允许多次转运和分批次满足各客户点的需求，所述多种运输方式包括多种内陆运输方式；以最小化综合运输成本作为优化的目标函数，求解所述空箱调运路径选择模型，获得优化的可行路径，其中所述综合运输成本包括运输成本、滞箱费、早到需求点的存箱成本以及晚到需求点的惩罚成本；基于所述优化的可行路径分配集装箱的运输路线及运输量。本发明对于解决复杂的空箱调运问题和推动运输行业的可持续发展具有深远的战略意义。