本申请公开了一种馈线故障自动化自愈方法及装置、存储介质。该方法包括：在故障区段为第二区段或第三区段或第四区段或第五区段的情况下控制分相磁控开关分闸；经过预设保护时间后控制分相磁控开关重合一相进行刺探性检测，在确定故障类型是永久故障的情况下令分相磁控开关保持单相合闸状态并记录短时来电延时；根据短时来电延时与有故障记忆的分段开关的第一整定值的比较结果，控制有故障记忆的分段开关的分合状态，根据短时来电延时与无故障记忆的分段开关的第二整定值的比较结果，控制无故障记忆的分段开关的分合状态，隔离故障区域；经过预设隔离时间后控制联络开关合闸，通过第二配电网馈线恢复后端的供电。能够提高供电可靠性。