本发明涉及数据传输技术领域，具体涉及基于高速加密的卫星通信报文数据传输方法，包括采集大气温度数据构成气象数据序列，并将其划分为各个块；获取每个块中大气温度数据的波动程度，进而得到获取每个块的影响块个数；根据每个块的影响块个数，获取每个块的影响块；获取每个块对其每个影响块的影响程度，进而获取每个块的重要程度；获取每个块的每轮加密数据的混淆程度，得到每个块的每轮加密数据的混淆程度变化；根据每个块的每轮加密数据的混淆程度变化以及每个块的重要程度，获取每个块的每轮加密数据的优选程度，进而得到每个块的最优加密轮次并对每个块中的大气温度数据进行加密传输；本发明自适应最优加密轮次，提高了加密效率。