本申请提供一种基于清洗球的自动清洗系统，包括输料管、连接管及清洗球，输料管形成有输料通道、进料口、出料口及两个连通口，进料口、出料口及两个连通口均与输料通道连通，进料口用于连通于输料泵的出料端；连接管的数目为两个，分别为第一连接管及第二连接管；与第一连接管连通的连通口靠近进料口设置；上述的基于清洗球的自动清洗系统，使控制器能够在接收到不同信号时分别控制所述进清洗液管的开关控制阀、压缩气源管的开关控制阀及排污水管的开关控制阀的开关动作，实现对输料、清洗球、清洗输料通道及清洗球三种不同状态切换，实现对输料、清洗球、清洗输料通道及清洗球的自动化，减少人工介入，降低人工劳动强度。