本申请涉及一种脉冲电镀多层电磁屏蔽复合膜及其制备方法，其中，一种脉冲电镀多层电磁屏蔽复合膜制备方法包括如下步骤：S1：对待处理基材的表面进行化学镀镍，获得镀镍打底层；S2：在电镀溶液中采用脉冲电镀的方式对镀镍打底层电镀Ni‑Fe合金，并在脉冲电镀的过程中循环更换至少两次不同的脉冲阴极电流密度，获得至少具有两层Ni‑Fe合金脉冲电镀层的脉冲电镀电磁屏蔽膜；S3：在脉冲电镀电磁屏蔽膜的外侧镀Ni层，获得具有外镀层的复合合金；S4：将具有外镀层的复合合金进行清洗，清洗后置于真空干燥箱内，真空加热干燥，完成去除内应力和除氢处理。通过本申请制备方法制得的脉冲电镀电磁屏蔽膜，层间界面可以使器件的电磁屏蔽能力得到很大提升。