本发明涉及检测设备技术领域，公开了一种采用荧光标记的免疫层析检测设备及其使用方法，其设备包括免疫层析试纸盒，包括检测区和采样区，采样区和检测区分设于免疫层析试纸盒的两端，待检测试剂滴入采样区，待检测试剂由采样区移动至检测区，用于检测待检测试剂中相应指标的含量。本发明试纸条采用同一采样区分为两路检测区，利用同一检测试剂能分时检测两种物质，可快速排查出血样中的C反应蛋白和三磷酸腺苷的浓度信息，有效地避免同一份样本进行真菌和细菌测试时，真菌和细菌测试会交叉影响。