本发明公开了基于双模通信的智能分布式配网保护方法，属于配电网保护领域，包括：采集配网电流序列并编号；通过第一通信模式获取配网电流序列的平均时延，确定第二通信模式下的输入到输出的时延抖动；输入端采样点信息到达输出端后更新输入端电流序列；基于输出端采样时间对输出端电流序列与输入端电流更新序列加窗；使用插值法对输出端未到达的输入端的采样点进行拟合，填充电流值；计算数据窗内电流序列之间的相关系数；基于相关系数和输入端到输出端的时延抖动进行仿真，设置相关系数门槛值，若相关系数高于门槛值则启动保护。本方案通过双模通信的方式确定输入端到输出端的时延抖动，根据仿真结果进行配网保护，显著提高了配电网的安全性。