一种电力交换机现场在线安全升级程序的系统及方法。本系统包括程序存储模块、CPU控制模块和FPGA数据处理模块；基于现场运行装置，通过以太网接口将FPGA数据处理程序和CPU控制程序写入程序存储模块，不需要退出交换机外接设备或者断开交换机业务端口连接；然后FPGA数据处理模块从程序存储模块中加载FPGA数据处理程序，CPU控制模块从程序存储模块中加载CPU控制程序；FPGA数据处理模块加载完成后，完成初始化自检工作，启动以后输出响应告知CPU控制模块，且端口处于初始化状态；CPU控制模块加载完成后，完成初始化自检工作，同时接收与CPU连接的其他芯片工作状态，并将响应状态传递给FPGA数据处理模块；最后完成FPGA数据处理模块的端口功能配置。