本发明公开了一种自动化废水处理系统及方法，系统包括废水处理装置本体和控制系统；废水处理装置本体包括蓄水池、沉降腔、沉淀池和净化池，沉降腔的顶部设置有加药罐，沉降腔的底部设置有第一电机，第一电机的输出轴上连接有第一转杆，第一转杆上连接有多个第一搅拌桨，第一转杆的底端连接有第一齿轮，沉降腔底板上通过销轴转动连接有第二齿轮，第一齿轮与第二齿轮啮合，沉降腔内壁上通过轴承转动连接有转盘，转盘内壁上设置有齿环，第二齿轮与齿环啮合，转盘顶部竖直设置有两根第二转杆，第二转杆上连接有多个第二搅拌桨，第一搅拌桨与第二搅拌桨交错设置。本发明能够有效应用在废水处理中，自动化程度高，提高处理效率，便于推广使用。