本发明公开了GhANN11基因在调控陆地棉耐寒性和耐热性中的应用，属于基因工程技术领域。该GhANN11基因的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。本发明实验发现：GhANN11基因在低温和高温胁迫中显著表达。通过将目的基因进行克隆，构建目的基因的VIGS沉默载体，研究其调控非生物胁迫的生物学功能，结果发现，GhANN11基因沉默在低温胁迫下导致陆地棉的叶片萎蔫影响陆地棉的生长发育，在高温胁迫下使陆地棉长势更好。以此证实GhANN11基因正向调控陆地棉对低温的耐受性，负向调控陆地棉对高温的耐受性。本发明为陆地棉应对非生物胁迫提供重要基因资源。