本发明公开了一种基于增量型编码器的飞剪剪刃标定系统，属于钢铁生产技术领域，解决绝对值编码器容易受设备运转过程产生的振动影响而导致剪刃位置发生偏移的技术问题，系统包括控制器、增量型编码器、接近开关、感应挡铁，增量型编码器安装在飞剪电机的电机轴，接近开关安装在飞剪减速机的侧壁，感应挡铁安装在飞剪减速机的上剪刃连接轴或下剪刃连接轴，接近开关与剪刃点在同一个垂直平面，上剪刃旋转至最低点时，接近开关能有效感应到感应挡铁，控制器电性连接增量型编码器、接近开关、飞剪电机；控制器设有参考坐标系设定模块、检测及计算模块、标定控制模块。本发明使得增量型编码器远离飞剪减速机，有效避免了机械振动的影响。