本申请公开了一种色素万寿菊遗传转化方法。色素万寿菊遗传转化方法包括：从原农杆菌菌液中培养出的单菌落移入含有25mg/L的利福平和50mg/L的卡那霉素的固体YEB培养基中进行培养，从培养完成后的菌液中选取呈阳性的菌液进行保存作为目标农杆菌菌液，以使用目标农杆菌菌液制备重悬液；将去除种皮的色素万寿菊种子置于无菌水中进行催芽后移入重悬液中，加入silwettL‑77和乙酰丁香酮，摇匀后进行超声波处理，再经二次真空处理，从而完成对色素万寿菊种子的浸种转化以实现色素万寿菊遗传转化。该申请利用农杆菌浸种法实现色素万寿菊的遗传转化，只需要要成熟的种子，无需进行组织培养，是一种简单有效的实现色素万寿菊遗传转化的方式。