本发明公开一种电磁暂态仿真方法、系统及计算机可读存储介质，其中，方法包括：选取第一步长和第二步长，并计算第一步长与第二步长之间的比值k；构建第一步长网络传递给第二步长网络的等值模型；令第一步长网络仿真处于暂停接受指令状态；开始第n次第二步长网络的解算，n初始值取1；当n＝k时，停止计算，并将第二步长网络的最后一次求解结果传递至第一步长网络计算，并输出最终计算结果。本发明采用了至少两种步长进行混合步长仿真，可以很好地适应系统稳定运行、故障情况，还可扩展应用于多端系统的动态响应研究。与小步长电磁暂态仿真相比，减少了仿真算法耗时；与大步长电磁暂态仿真相比，有效地提高了仿真精度。