本发明提供了一种从灯盏细辛中提取活性成分的方法，属于医药技术领域。本发明根据化合物理化性质差异，先实现咖啡酸酯类化合物和灯盏花乙素初步分离，之后针对两类物质的性质进一步纯化分离；其中，本发明采用不同浓度的乙醇水溶液分步提取咖啡酸酯类化合物，并用大孔树脂和微孔树脂分离对咖啡酸酯类化合物进行初步分离，通过酸碱处理对灯盏花乙素进行初步分离，最后基于反相工业色谱纯化获得高纯度的飞蓬酯乙、3,5‑二咖啡酰基奎宁酸、3,4‑二咖啡酰基奎宁酸、4,5‑二咖啡酰基奎宁酸和灯盏花乙素。本发明实现了灯盏细辛中多种活性成分的提取分离，且提取分离过程中所用溶剂均可回收，成本较低。