本申请提供一种水底沉积物取样装置，属于样本采集装置技术领域，装置包括：壳体内部具有安装腔，壳体的底部具有配重结构，壳体的外部沿圆周阵列设有至少三支喷嘴，喷嘴的出口倾斜朝向壳体外侧的下方。取样管垂直穿设于壳体的底板，取样管的上端设于一升降装置的活动杆下端。防护管设于壳体的底部下方，取样管同轴穿设于防护管内，防护管的下端沿圆周设有多块盖板，盖板摆动设于防护管的外部，且盖板与防护管之间设有顶紧弹簧。本方案可防止样本丢失或被水稀释，能排出水草对取样的影响，并且能在不同的水深环境下进行取样。