本发明公开了一种麦属特异转座子H2A.1及其应用，所述转座子H2A.1的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示。其可以起到增强子的作用，提高目的基因的表达。本发明通过构建转座子H2A.1的烟草瞬时转化载体，利用农杆菌侵染法转化本式烟草，获得瞬时过表达烟草，验证转座子激活基因的功能。分析结果表明该转座子可以激活目的基因的转录，并且不受到现有目的基因的影响，可以无差别的激活下游目的基因，并且激活的强弱与TSS位置成正相关，距离TSS位置越近激活效果越强，反之效果变弱。该结果提供了小麦过表达目的基因的新思路，仅通过引入一段221bp的片段就可以大幅度的提高目的基因的转录水平，提供了切实可用的过表达序列资源。