本发明提供了一种复杂混联电网雷害风险评估简化模型的构建方法及系统，该方法包括以下步骤：基于待评估电网的历史数据，收集线路雷击故障特征向量，并对线路雷击故障特征向量进行编码处理；对编码处理后的线路雷击故障特征向量进行相关性分析，将相关性排序处于设定名次区间的线路雷击故障特征向量作为初步因子；将初步因子作为回归模型的输入变量，对回归模型进行训练，根据训练完成的回归模型验证初步因子的合理性；对编码处理后的线路雷击故障特征向量进行聚类分析，根据聚类分析结果在通过合理性验证的初步因子中选取致灾因子；基于待评估电网的历史数据，构建用于表征致灾因子和雷害风险数学关系的简化模型。本发明可以有效评估雷害风险。