本发明公开一种模块化集成的黏土基再生骨料生产系统及其运行过程，所述模块化集成的黏土基再生骨料生产系统包括：配料模块、骨料制造模块和控制模块，所述配料模块包括：粘结剂料仓、添加剂料仓、掺合料仓、粉碎设备、自动计量单元和搅拌设备；所述骨料制造模块包括：拌和料传送带、挤料成型设备和黏土基再生骨料仓；所述控制模块包括：控制系统。本发明采用模块化集成的黏土基再生骨料生产系统，免烘干规模化资源化利用含水率大的泥胶状废弃物，有效解决了含水率大的胶状固体废弃物治理花费大、危害生态环境和不可持续的工程、社会和生态治理难题，同时所生产的黏土基再生骨料原材料价廉易得。