本发明公开了一种综合能源系统购能组合优化方法及系统，方法包括以下步骤：针对综合能源商业综合体内部多能设备进行建模，以体现各设备的多重能量耦合关系，并确定安全运行约束条件；基于历史各类能量负荷的功率数据，使用随机优化法，对电力中长期市场和现货市场的价格数据建模，并确定各类不确定性分布；使用蒙特卡洛模拟出多场景并利用k均值法进行场景缩减得到几个显著场景与各场景的概率；确定目标函数，即在不同场景下考虑了条件风险价值、运行成本和购能成本的综合能源商业综合体的总成本最小；使用Matlab描述该最优化问题，并使用gurobi商业求解器求解，可以得到在该风险下综合能源商业综合体的购能组合方法。