本发明公开了一种新能源高渗透率局部电网的高频切机方案配置方法及系统，属于电力及电气工程技术领域。本发明方法，包括：确定所述局部电网在正常运行方式下，常规发电机的多种开机组合；划分出所述局部电网的负荷水平区间；根据所述新能源切机规模及常规发电机切机规模，确定所述局部电网待切除的新能源场站及常规发电机；对所述新能源高渗透率局部电网的高频切机方案进行配置。本发明通过合理划分电网可能的运行方式区间，采用尽可能简单的方式将新能源机组纳入电网高频切机方案，减少了常规机组切机量，增强了新能源高渗透率局部电网抗扰动能力，提升了新能源高渗透率局部电网安全运行范围。