本发明涉及电能计量技术领域，具体涉及一种光伏发电计量故障的监测方法及系统，通过对光伏发电站的工作状态数据进行获取，得到周期内光伏发电站的实际发电电能，将周期内光伏发电站的实际发电电能与光伏发电站的认证输出电能进行处理，得到周期内光伏发电站校验电能，对光伏发电站m个周期内的光伏发电站校验电能进行获取，在m个周期内对存在周期内光伏发电站校验电能＞周期内光伏发电站校验电能阈值的周期个数n进行获取，在n/m≥0.3时，则表示光伏发电站运行故障，从而完成对光伏发电站故障的确定，对于光伏发电计量故障类型能够进行有效识别，保证光伏发电计量故障得到及时有效的处理，适用性广。