本发明公开一种税务办公系统非流程弹窗自动化处理方法及系统，涉及弹窗处理技术领域，方法包括：配置弹窗关键字；设置窗口办公系统启动时关键字实时生效，并支持关键字动态更新；适配自动化测试平台，以在平台获取到配置的弹窗关键字后，用户根据需求对需要自动点击的弹窗进行个性化处理；平台从税务办公系统的窗口业务组件获取关键字，主动识别需要自动处理的弹窗和无需自动处理的弹窗，并在点击弹窗时自动生成一张弹窗截图，在自动处理的弹窗轨迹中生成一条对应的测试记录，以供用户后期核对校验。本发明针对非流程弹窗实现了无侵入式自动化测试，提高了系统代码的安全性，保证了测试结果的准确性，使得测试记录有迹可循。