本发明公开了一种基于熵效率模型的供用水系统稳定性量化方法，包括以下步骤：根据特大干旱情景下供用水系统稳定性的内涵，构建稳定性熵流指标体系；根据稳定性熵流指标体系计算供用水系统的正负熵流；结合DEA模型，构建供用水系统稳定性量化熵效率模型；基于正负熵值求解熵效率模型，得到供用水系统的稳定性量化结果。本发明基于耗散结构理论与熵理论，结合DEA模型，从调控的角度提出了特大干旱情景下构建熵效率模型量化供用水系统稳定性的方法，解析供用水系统在受到特大干旱干扰时稳定性的演化特性，为防旱减灾工作的开展提供实践指导，有助于科学应对特大干旱，从而降低特大干旱对供用水系统的损害，保证正常的生产生活秩序。