本发明公开了与大麦苗期干物质积累能力相关的SNP分子标记开发及其应用，属于分子标记辅助育种技术领域。本发明提供了一种与大麦苗期干物质积累能力相关的SNP分子标记，该分子标记所在片段如SEQ ID No.3所示，且在所述片段的327bp处存在多态性C/T，C时为优势性状。本发明通过对大麦苗期干物质含量进行全基因组关联分析，鉴定到对苗期干物质能力有显著提高作用的SNP位点，首次公开了一个与大麦苗期干物质含量显著相关联的SNP分子标记，该分子标记检测准确高效、扩增方便稳定，可用于分子标记辅助选择，提高不同大麦品种的鉴定效率。