本发明公开了一种振动台随机功率谱复现控制方法及系统，包括以下步骤：1、估计振动台频响函数；2、计算初始驱动谱、初始频响函数和初始响应谱；3、初始响应谱判断是否达到功率谱复现精度；4、计算误差谱；5、计算修正后频响函数和迭代步长；6、对驱动谱进行迭代修正；7、计算响应谱和频响函数；8、判断是否达到功率谱复现的精度；包括工控机、采集板卡、驱动板卡、信号调理装置。本发明通过迭代过程中结合历史数据信息对每个频率点进行定量评价和动态修正，利用修正后每个频率点频响函数准确度对迭代步长进行定量优化，克服频响函数波动对功率谱复现精度的影响，提高振动台随机功率复现控制精度。