本发明公开了一种基于配网主站分片三遥增量标识故障识别方法及系统，涉及故障识别技术领域，包括收集三遥增量标识信号数据，并对数据进行预处理；将收集的数据分块进行分解提取特征向量并使用希尔伯特变换连接成新的特征序列；构建模型，将新的特征序列输入预训练的模型中，获得每片数据块的增量标识结果；进行汇总和过滤，得到三遥故障检出结果并进行处理。本发明通过整合分析配网主站系统内的数据对配网开关进行非自动化开关、二遥开关及三遥开关标记，方便调度人员及自动化人员分析决策，为其他应用程序提供了底层数据。且显著提升了电力系统故障监测的准确性，实时性和自适应性，为电力系统的稳定运行和故障预测提供了更为可靠的解决方案。