本发明公开了一种井下自接替密封封隔器及使用方法，包括中心管以及套装在中心管外部的胶筒、液压传动机构；所述胶筒包括上密封胶筒、接替密封胶筒，所述上密封胶筒内壁与中心管外壁之间具有上间隙，所述接替密封胶筒内壁与中心管外壁之间具有下间隙；所述液压传动机构包括缸套、隔离坐封活塞、接替控制活塞；所述缸套套装在中心管外部，且缸套上端连接上密封胶筒下端，缸套下端连接接替密封胶筒上端；所述缸套与中心管之间构成活塞腔，所述隔离坐封活塞、接替控制活塞均置于活塞腔内；所述隔离坐封活塞下端与接替控制活塞上端连接在一起。提供备用密封系统，当封隔器密封失效后，启动备用密封系统，继续实现油套密封，从而延长分层密封有效期。