本发明公开了一种氢气管道安全清管发球系统与方法。为了克服氢气增压后可能引起部分气体的温度过高，造成清管系统内出现材料性能衰减，存在安全风险的问题；本发明在管道清管回路上设置有：流量控制单元，设置于上游氢气管道与清管发球筒之间的大筒体支路的截断阀的旁路，检测并控制冲压流量；压力监测单元，设置于清管发球筒的盲板端口处，监测端口处的压力；温度监测单元，沿清管发球筒的清管方向分布设置，监测各位置的温度。识别在氢气管道发球操作中可能存在的短期高温特点，通过设置流量控制、温度监测，有效克服氢气充装与升压过程中的局部气体高温问题，保障氢气管道清管发球操作安全实施。