本发明提供了一种电厂循环冷却水系统补水方法。该方法包括：1)确定能够实现循环冷却水系统的冷却塔内填料中生活的微生物种群出现硝化细菌、亚硝化细菌成为优势菌种的补充水氨氮浓度、补充水氮磷比、浓缩倍率以及进入冷却塔的循环冷却水温度；2)调整城市中水的氨氮浓度达到步骤1)确定得到的补充水氨氮浓、氮磷比达到步骤1)确定得到的补充水氮磷比，得到循环冷却水系统中水补充水；3)根据步骤1)确定的浓缩倍率确定补水量；4)将步骤2)得到的循环冷却水系统中水补充水作为循环冷却水系统补充水按照步骤3)确定的补水量进行循环冷却水系统补水，同时控制循环冷却水系统内循环冷却水的温度为步骤1)确定得到的温度。