本发明公开一种基于数据分析的儿童呼吸道疾病预测系统及方法，涉及数据分析领域，其中，基于数据分析的儿童呼吸道疾病预测系统包括：电子病历数据获取模块、结构化特征数据获取模块、特征选择策略输出模块、降维操作模块和呼吸道疾病预测模块。本发明通过在特征选择策略库中选取与实时获取的电子病历数据对应的结构化特征数据相似度较高的标准结构化特征数据，并根据标准结构化特征数据对应的特征选择策略对实时获取的电子病历数据对应的结构化特征数据进行降维操作，在保证呼吸道疾病预测的准确率的前提下，减少了数据量，进而提升了呼吸道疾病预测的准确率。