本发明公开了一种智能变电站继电保护运维系统。本发明中，二次回路监测模块内部设置的各个监测模块提高监测效率，为整个电网的稳定运行提供保障，进而为我国电力事业建设及发展注入强大推力，也为后期的研究提供了依据和方向，加快智能化的进程。结合过程层和链路层的异常信息特征，进行SV/GOOSE网络诊断、交流回路状态诊断、保护动作诊断分析，并结合回路专家库对二次设备的运行状态进行判断，最后以实际算例进行验证，结果表明所提系统能够及时有效地进行二次回路的运行障碍诊断，能够有效检修出智能变电站的问题所在，从而提高了整体检修精度，保证了智能变电站的正常运行。