本发明提供一种间充质干细胞提取装置，涉及干细胞培养提取技术领域，包括桶体、驱动机构、存储层和提取层，所述桶体的顶部连接有间充质干细胞输入管道，所述桶体的侧边连接有液氮输入管道，所述存储层和提取层均安装在桶体的内部，且提取层设置在存储层的底端，所述驱动机构设置有两组，且两个驱动机构以对称的形式安装在桶体内部的两侧，该提取装置在桶体的内部通过隔板将存储层和提取层进行分隔处理，因此提供的震动效果不会影响到存储层内部的间充质干细胞，避免对干细胞整体都产生干扰，通过存储层和提取层对干细胞进行了初步转移，因此积存在存储层底部的絮凝状沉淀部分能够避开，降低了沉淀对提取物的品质影响。