本发明属于海洋工程领域，具体地，涉及一种水下生产控制系统智能维修决策方法及系统。一种水下生产控制系统智能维修决策方法，包含5个步骤：非线性维纳过程模型固定参数估计、基于卡尔曼滤波的漂移参数更新、剩余使用寿命预测、维修优化目标确定和基于多智能体深度强化学习的预测性维修优化。水下生产控制系统智能维修决策系统，包括固定参数估计模块、漂移参数更新模块、组件剩余使用寿命预测模块、维修优化目标评价模块、预测性维修优化模块、维修优化结果输出模块。