本发明公开了一种基于大数据的电子病历合格程度评价方法及系统。该基于大数据的电子病历合格程度评价方法，包括以下步骤：通过医患数据构建传输模型，通过传输模型获得医患数据库日志，根据诊断数据、传输模型和医患数据库日志分别分析得到信息识别准确度评估指数、传输稳定评估指数和电子病历准确指数，根据信息识别准确度评估指数、传输稳定评估指数和电子病历准确指数得到电子病历真伪指数，通过电子病历真伪指数明确电子病历合格程度。本发明通过电子病历真伪指数得到电子病历真伪性，通过电子病历真伪性明确电子病历合格程度，达到了准确地明确电子病历合格程度的效果，解决了现有技术中存在难以准确地明确电子病历合格程度的问题。