本发明涉及电力系统保护控制领域，公开了一种电容电流分段补偿计算方法及系统，本方案将长线路分为若干段短线路，采集长线路两端点处的电压和电流，然后利用短线路上某一端点处已知的电压、电流根据线路沿线电压呈线性分布计算相邻端点处的电压；根据短线路两个端点处的电压计算对应短线路上的电容电流；根据短线路上某一端点处的电流和该短线路的电容电流计算该短线路另一端点处的电流，直到计算出每段短线路上的电容电流；然后对每段短线路上的电容电流进行逐段补偿。能够提高滤波器的截止频率，缩短滤波器的延时，提高保护动作速度。