一种考虑光伏逆变器冗余容量的谐波抑制方法及系统，其特征在于，方法包括：在所述光伏逆变器中提取交流并网电流中的基波和各次谐波，并计算所述交流并网电流、所述基波、所述各次谐波的有效值；从低次谐波开始，将所述各次谐波依次并入基波以获得初步参考电流，利用限制电流判断所述初步参考电流的大小，并获得剩余电流；通过剩余电流求解出当前迭代次数下的新增第j次谐波的限流增益，并利用所述限流增益将所述当前迭代次数下的新增谐波添加至所述光伏逆变器的初步参考电流中；遍历完成所述交流并网电流的各次谐波，以根据所述基波、所述各次谐波的有效值以及所述限流增益，生成所述光伏逆变器的参考电流，并控制所述光伏逆变器的输出。