本发明提供用于光伏电场的混合储能系统协调控制方法及系统，属于光伏发电技术领域。包括：以单个电池健康状态为基础，通过数据驱动的方法建立锂离子电池寿命模型；根据储能阵列的容量限制与充放电电量，计算出锂电池储能阵列的SOC变化区间和飞轮储能的SOC变化区间；针对VMD初步分解得到的高频功率信号、低频功率信号，使用粒子群算法进行滤波寻优，基于飞轮储能的SOC变化区间，获得全局最优解对应的高低频分界点；根据全局最优解对应的高低频分界点重新分配锂电池储能阵列的功率指令以及飞轮储能的功率指令；基于所述锂电池寿命模型，根据优化后的充放电功率指令计算出锂电池充放电次数。