本发明公开了一种油浸倒置式电流互感器绝缘劣化缺陷诊断方法及系统。本发明通过在线监测装置实时测量油浸倒置式电流互感器的末屏电流，计算高频特征量；当高频特征量变化率≥50%时，计算末屏电流的三相不平衡电流矢量和3I0及高频分量占比，且当三相不平衡电流矢量和3I0的变化率≥3%及高频分量占比≥35%时，诊断油浸倒置式电流互感器内部存在绝缘劣化缺陷，在故障发生前发出告警信息。本发明通过测量油浸倒置式电流互感器末屏电流，依据末屏电流高频特征量与设备内部局部放电及绝缘劣化的对应关系，实现油浸倒置式电流互感器绝缘劣化缺陷的有效诊断和及时预警。