本发明公开了湿垃圾资源化处理碳核算及评价指标体系建设方法及系统，方法包括：确定湿垃圾资源化处理工艺碳排放与碳减排的核算地理边界和核算流程边界；依据湿垃圾资源化处理工艺的碳排放与碳减排来源，建立湿垃圾资源化处理工艺碳排放核算方法；根据实质性、可比性、反映关键技术和排放与运行数据关联原则，确定湿垃圾资源化处理评价指标；根据湿垃圾资源化处理评价指标，建立湿垃圾资源化处理评价指标的核算方法。本发明结合湿垃圾资源化处理工艺的具体技术特点和运行特点，进行项目碳排放源计算分析和指标计算比较分析，综合对所核算湿垃圾资源化处理项目的碳减排路径分析，进而为湿垃圾处理行业设定与路径设计提供参考。