本发明公开了一种烟草智慧物流运输系统，包括：信息输入模块，用于通过电子代码技术录入烟草产品数据信息；入库模块，用于安排烟草产品的分类入库，进行暂存处理；流转感应模块，用于根据追踪烟草产品厂内流转情况，实时监管烟草产品位置、库存量以及储存时间；出库模块，用于安排记录烟草产品的出库；库存模块，用于查询各类烟草产品的库存量；报警模块，用于根据烟草产品库存量、保质期以及安全性发出的报警；客户管理模块，用于记录和管理与客户单位签署的合同信息以及烟草产品数据信息；订单生成模块，用于根据与客户单位签署的合同信息生成对应的订单单据。本发明提升了烟草产品的追踪与控制水平，降低资金、人员占用，提高了管理效率。