本发明涉及一种用于微分型电子互感器的方向保护方法及系统，属于电力系统继电保护技术领域。根据故障发生后各工频周期的三相电流的突变量判断是否启动保护，当保护启动后，利用三相电压和三相电流的相量值计算得到正序电压值和对应的正序电流值，通过所述的正序电压值和正序电流值得到正序电压突变量和正序电流突变量，根据微分型电子互感器的传递函数在工频下的相位响应对正序电压突变量和正序电流突变量的相位差值进行修正，当任一采样点满足正序电压突变量、正序电流突变量和两者修正后的相位差值对应的动作条件，则该采样点的方向元件动作，本方法提高了保护动作的可靠性。