本发明公开了基于海林格距离算法的光伏送出线路纵联保护方法及系统，包括：采集光伏送出线路的三相电流，计算电流采样值离散概率分布并进行故障判别；计算线路两端电流采样值离散概率分布的海林格距离，通过海林格距离实现对线路两端电流采样值离散概率分布相似度的量化；利用海林格距离构造纵联保护动作判据，代入线路两端电流，当保护动作判据满足时进行线路纵联保护。本发明方法利用海林格距离算法定量地描述了故障后线路两端电流采样值分布的相似度，根据海林格距离计算结果与整定值进行比较，在区内故障时能够自然选择故障相别且可靠动作，区外故障时不误动，提升了保护性能，具有较高的灵敏度与耐受过渡电阻能力。