本发明涉及燃料后处理设备技术领域，公开了一种混合澄清槽及乏燃料后处理系统，本发明的混合澄清槽包括槽本体和搅拌机构。其中，槽本体包括至少一级混合澄清槽体，每级所混合澄清槽体包括混合室、澄清室和分离室，搅拌机构设于混合室内；搅拌机构的搅拌叶片包括柔性叶片。此结构的混合澄清槽，搅拌叶片包括柔性叶片，柔性叶片在搅拌有机相和水相过程中可以吸收部分能量，减少水相和有机相之间的摩擦，减少两相混合过程中产生的乳化现象，从而减少界面污物的产生，进而减少清理界面污物的频率和次数；混合澄清槽界面污物产生量降低，混合澄清槽运行问题减少，从而提高混合澄清槽运行状态的稳定性。