本发明属于制备氢气的工艺和系统技术领域，提供了一种甲醇制氢工艺和甲醇制氢系统。制氢工艺包括：将第一部分甲醇在氧源和第一催化剂的存在下进行甲醇部分氧化反应，以提供第一热量和包含氢气的携带第三热量的第一合成气；利用第一热量将脱盐水转换成水蒸气；将第二部分甲醇与水蒸气混合，在第二催化剂的存在下进行甲醇蒸汽重整反应，以提供包含氢气的携带第二热量的第二合成气；其中，利用第一热量提供水蒸气的过程同步于甲醇部分氧化反应过程。通过脱盐水同步吸收部分氧化反应过程中产生的热量，在部分氧化反应进行的同时利用了第一热量，从而避免了局部反应温度过高导致第一催化剂失效，提高了甲醇部分氧化反应的平稳性。