本发明提供了一种亚磷酸基低分子减水剂的制备方法及其应用，制备方法包括以下步骤：一氯代醇的前处理；含氯聚醚大单体的制备；亚磷酸基低分子减水剂的制备。本申请提供的亚磷酸基低分子减水剂制备中，为了保证后续减水剂减水效果，聚醚大单体仅通入环氧乙烷，而通过特有的前处理工艺，实现了DMC直接接枝环氧乙烷。本申请提供一种制备工艺简单，保坍、缓凝和粘土耐受性优异的含亚磷酸基低分子减水剂的制备方法。聚醚合成即完成氯的引入，且不引入过多的酸性物质，有利于后续与多元胺的反应，转化率较高，最终产物性能好。另外，无须额外的脱酸步骤，对设备有利，对操作有益，便于工业化生产实施。