本发明公开了基于有源谐波补偿的海上风电谐波谐振治理方法及系统，涉及电力系统技术领域，包括，对海上风电系统的谐波源产生的谐波电流电压进行实时监测，分析谐波电流的频率、幅值以及相位参数，识别出系统中存在的谐波谐振问题和放大特性；构建海上风电谐波谐振数学模型，分析海上风电谐振影响因素和放大关键因素；改变系统阻抗移动并联谐振点并布置有源谐波补偿装置进行综合谐波抑制和补偿；根据改变系统阻抗的抑制效果和有源谐波补偿装置的补偿效果进行补偿策略的优化改进。本发明通过构建数学模型、谐波抑制补偿，实现海上风电场谐波谐振的有效治理，提高运行效率和电能质量，降低设备损害和电网不稳定的风险，增强系统的自适应性和鲁棒性。