本发明公开了一种电路数据压缩重构方法、系统及存储介质，属于电路数据处理领域，包括：S1、对电路输出信号稀疏变换，得到对应的稀疏度K；并获取对应的测量信号和观测矩阵；S2、计算观测矩阵中每列元素与上次迭代残差间的相关性，取相关性强的前2K个值对应元素的列构成当前迭代的列集合，以获得当前累计迭代的列集合矩阵；S3、以最小化当前迭代残差为目标，求解得到最小二乘解并从中选出绝对值最大的K项作为最优解；S4、更新当前迭代残差；S5、若t＞K或残差小于预设的阈值，停止迭代，并执行S6，否则，执行S2；S6、对当前迭代所得的最优解进行反稀疏域变换，以对所述输出信号重构。本发明能够降低数据的存储和处理成本，并提升数据传输的实时性。